تازه ها در میکروب شناسی دامپزشکی

تازه ها در میکروب شناسی دامپزشکی

مطالعه فیلوژنتیکی اولین شیوع تحت تیپ H5N8 ویروس آنفلوانزای فوق حاد پرندگان در مرغداری گوشتی در استان خراسان جنوبی، 2021-2020

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 گروه میکروبیولوژی و ایمنی شناسی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
2 موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، البرز، ایران
3 گروه علوم بالینی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد کرج، البرز، ایران
4 گروه میکروبیولوژی و ایمنی شناسی ،دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران ، تهران ، ایران
10.22034/nfvm.2025.491356.1268
چکیده
شیوع تحت‌تیپ 5 H ویروس آنفلوانزای فوق‌حاد پرندگان علاوه بر وارد آوردن خسارات اقتصادی بر بدنه­ی صنعت طیور، از نظر بهداشت عمومی نیز یک تهدید بزرگ محسوب می­گردد. رخداد آنفلوانزای فوق‌حاد پرندگان علاوه‌بر این‌که می­تواند سبب بروز تلفات بالایی دربین جمعیت پرندگان شود، به‌دلیل توانایی انتقال به انسان و بیماری‌زایی می­تواند بهداشت عمومی را نیز درخطرقرار دهد. به همین سبب مطالعه­ی شیوع و چرخش این بیماری در کشور از اهمیت بالایی برخوردار است. در مطالعه­ی حاضر، در سال 2021، نمونه­های نای از 50 جوجه­­ی تلف شده در یک مرغداری گوشتی در استان خراسان جنوبی در شهر بیرجند، جمع آوری شد. نمونه­های جمع‌آوری شده در کنار یخ به آزمایشگاه منتقل شده و تا زمان شروع آزمایش در دمایC °20- نگهداری شدند و سپس با استفاده از روش RT-PCR از نظر آلودگی با تحت‌تیپ 8N5 H ویروس آنفلوانزای فوق‌حاد پرندگان، مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج آزمون RT-PCR حضور ژنوم این تحت‌تیپ از ویروس را در نمونه­های جمع‌آوری شده تایید کرد. بر اساس نتایج آنالیز فیلوژنی این مطالعه که با استفاده از نرم افزار 7 MMEGA و توالی­های پیشین ثبت شده در بانک ژنی (NCBI GenBank) ، ویروس 8N5 H جداشده در این مطالعه، دارای بیش‌ترین شباهت در نوکلئوتید (99/2%) به ویروس 8N5H (2019)/4(A/DUCK/EGYPT/SMG جدا شده در کشور مصر در سال 2019 و همچنین 91/08% شباهت با ویروس (8N5H2017 A/Crow/Aghakhan/)، جداسازی شده از کشور ایران در سال 2017 می­­باشد. نتایج این مطالعه با تایید حضور این ویروس در ایران، بر ضرورت پایش مداوم برای مدیریت خطرات اقتصادی و بهداشتی تاکید می­کند.(8N5H2017 A/Crow/Aghakhan/)
کلیدواژه‌ها
موضوعات

عنوان مقاله English

Phylogenetic Study of First Outbreak of Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Broiler Chicken Farm in South Khorasan Province, 2020-2021

نویسندگان English

Zahra Ziafati Kafi 1
Soroush Sarmadi 1
Mohammad Hossein Fallah Mehrabadi 2
Mohammad Abdoshah 2
Mohsen Mahmoudzadeh Akhijahani 2
Fahimeh Jamiri 1
Alireza Bakhshi 1
Hossein Hosseini 3
Omid eghbali 1
Nazanin Sarvian 1
Arash Ghalyanchi Langeroudi 4
1 Department of microbiology and immunology, Faculty of veterinary medicine, University of Tehran, Tehran, Iran
2 Razi Vaccine & Serum Research Institute, Agricultural Research, Education & Extension Organization, Karaj, Alborz, Iran
3 Department of clinical science, Faculty of veterinary medicine, Karaj Islamic Azad university, Alborz, Iran
4 Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran
چکیده English

In addition to economic losses to poultry industry, outbreaks of H5 subtype of highly pathogenic avian influenza virus are considered as a major threat for public health. H5N8 subtype of highly pathogenic avian influenza virus was detected for the first time in China in 2010. In present study in 2021, 50 tracheal samples were collected from 30075 susceptible chicken in a broiler chicken farm located in Birjand city, south Khorasan province and the infection with H5N8 subtype in them was evaluated using RT-PCR method and partial sequencing of hemagglutinin encoding gene. Molecular assay confirmed presence of the genome of this subtype in collected samples. According to the phylogenetic analysis, H5N8 virus isolated in present study have the most nucleotide similarity (99.2%) with (A/Duck/Egypt/SMG4/2019/(H5N8)), isolated in Egypt in 2019 and 91.0% similarity with (A/crow/Aghakhan/2017(H5N8)) isolated in Iran in 2017. Results of current study confirm presence of this virus in Iran and highlighting the critical need to constant monitoring to manage economic and health risk.

کلیدواژه‌ها English

H5N8 Influenza
clade 2.3.4.4
poultry industry
Highly Pathogenic Avian Influenza
1.Ghafouri SA, Langeroudi AG, Maghsoudloo H,
Tehrani F, Khaltabadifarahani R, Abdollahi H,
et al. Phylogenetic study-based hemagglutinin (HA)
gene of highly pathogenic avian influenza virus
(H5N1) detected from backyard chickens in Iran,
2015. Virus Genes. 2017;53(1):117-20.
2.ElBakrey RM, El Sisi MA, Mansour SMG,
Ahmed HH, Rajput M, Eid AAM. Cleavage site
stability of Egyptian highly pathogenic avian
influenza viruses in backyard chickens during 2009–
2011. J Microbiol Immunol Infect. 2015;48(1):28-
35.
3.Mahmood AN, Allawe AB. Molecular
Characterizations of a High Pathogenic Avian
Influenza H5N8 in Iraq. Indian J. Forensic Med.
Toxicol. 2021;15(1):2134-40.
4.Lee D-H, Criado MF, Swayne DE.
Pathobiological origins and evolutionary history of
highly pathogenic avian influenza viruses. Cold
Spring Harb. Perspect. Med. 2021;11(2):a038679.
5.Monne I, Fusaro A, Nelson MI, Bonfanti L,
Mulatti P, Hughes J, et al. Emergence of a Highly
Pathogenic Avian Influenza Virus from a Low-
Pathogenic Progenitor. J Virol. 2014;88(8):4375-88.
6.Ghafouri SA, GhalyanchiLangeroudi A,
Maghsoudloo H, Kh Farahani R, Abdollahi H,
Tehrani F, et al. Clade 2.3.4.4 avian influenza A
(H5N8) outbreak in commercial poultry ,Iran, 2016:
the first report and update data. Trop Anim Health
Prod. 2017;49(5):1089-93.
7.Verhagen JH, Van der Jeugd H, Nolet BA,
Slaterus R, Kharitonov S, De Vries P, et al. Wild
bird surveillance around outbreaks of highly
pathogenic avian influenza A (H5N8) virus in the
Netherlands, 2014, within the context of global
flyways. Eurosurveillance. 2015;20(12):21069.
8.Poen MJ, Verhagen JH, Manvell RJ, Brown I,
Bestebroer TM, van der Vliet S, et al. Lack of
virological and serological evidence for continued
circulation of highly pathogenic avian influenza
H5N8 virus in wild birds in the Netherlands, 14
November 2014 to 31 January 2016.
Eurosurveillance. 2016;21(38):30349.
9.Li X, Lv X, Li Y, Xie L, Peng P, An Q, et al.
Emergence, prevalence, and evolution of H5N8
avian influenza viruses in central China, 2020.
Emerg. Microbes Infect. 2022;11(1):73-82.
10.Takadate Y, Tsunekuni R, Kumagai A, Mine
J, Kikutani Y, Sakuma S, et al. Different
infectivity and transmissibility of H5N8 and H5N1
high pathogenicity avian influenza viruses isolated
from chickens in Japan in the 2021/2022 season.
Viruses. 2023 Jan 17;15(2):265.11.Ghafouri SA, Fallah Mehrabadi MH,
Talakesh SF, Hosseini H, Ziafati Z, Malekan M,
et al. Full genome characterization of Iranian H5N8
highly pathogenic avian influenza virus from
Hooded Crow (Corvus cornix), 2017: The first
report. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis.
2019;64:73-80.
12.Abdollahi H, Maken Ali AS, Monne I, Milani
A, Habibi M, Zamperin G
,et al. Spatial spread and
emergence of reassortant H5 highly pathogenic
avian influenza viruses in Iran. Infect. Genet. Evol.
2020;83:104342 [In Persian].
13.Slomka M, Coward V, Banks J, Löndt B,
Brown I, Voermans J, et al. Identification of
sensitive and specific avian influenza polymerase
chain reaction methods through blind ring trials
organized in the European Union. Avian Dis.
2007;51(s1):227-34.
14.Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7:
molecular evolutionary genetics analysis version 7.0
for bigger datasets. MBE. 2016;33(7):1870-4.
15.Lee D-H, Torchetti MK, Winker K, Ip HS,
Song C-S, Swayne DE. Intercontinental Spread of
Asian-Origin H5N8 to North America through
Beringia by Migratory Birds. J Virol .
2015;89(12:)6521-4.
16.Kanehira K, Uchida Y, Takemae N, Hikono H,
Tsunekuni R, Saito T. Characterization of an H5N8
influenza A virus isolated from chickens during an
outbreak of severe avian influenza in Japan in April
2014. Arch. Virol. 2015;1.60-43.
17.Webster RG, Peiris M, Chen H, Guan Y.
H5N1 outbreaks and enzootic influenza.
Biodiversity. 2006;7(1):51-5.
18.Abolnik C, Pieterse R, Peyrot B, Choma P,
Phiri TP, Ebersohn K, et al. The incursion and
spread of highly pathogenic avian influenza H5N8
clade 2.3. 4.4 within South Africa. Avian Dis.
2019;63(1s):149-56.
19.Puranik A, Slomka MJ, Warren CJ, Thomas
SS, Mahmood S, Byrne AMP, et al. Transmission
dynamics between infected waterfowl and terrestrial
poultry: Differences between the transmission and
tropism of H5N8 highly pathogenic avian influenza
virus (clade 2.3.4.4a) among ducks, chickens and
turkeys. Virology. 2020;541:113-23.
20.Valley‐Omar Z, Cloete A, Pieterse R, Walaza
S, Salie‐Bassier Y, Smith M, et al. Human
surveillance and phylogeny of highly pathogenic
avian influenza A (H5N8) during an outbreak in
poultry in South Africa, 2017. Influenza Other
Respir Viruses. 2020;14(3):266-73.
21.Adlhoch C, Dabrera G, Penttinen P, Pebody
R. Protective measures for humans against avian
influenza A (H5N8) outbreaks in 22 European
Union/European Economic Area Countries and
Israel, 2016–17. Emerg. Infect. Dis. 2018;24(10)
22.Kouam MK, Tchouankui HN, Ngapagna AN.
Epidemiological features of highly pathogenic
avian influenza in Cameroon. Vet. Med. Int.
2019;2019(1):3796369.
23.Bertran K, Pantin-Jackwood MJ, Criado MF,
Lee D-H, Balzli CL, Spackman E, et al.
Pathobiology and innate immune responses of
gallinaceous poultry to clade 2.3.4.4A H5Nx highly
pathogenic avian influenza virus infection. Vet. Res.
2019;50(1):89.
24.Hemida MG, Chu D, Abdelaziz A, Alnaeem A,
Chan SMS, Peiris M. Molecular characterisation of
an avian influenza (H5N8) outbreak in backyard
flocks in Al Ahsa, Eastern Saudi Arabia, 2017–
2018. Vet. Rec. Open. 2019;6(1):e000362.
25.Kandeil A, Hicks JT, Young SG, El Taweel
AN, Kayed AS, Moatasim Y, et al. Active
surveillance and genetic evolution of avian influenza
viruses in Egypt, 2016–2018. Emerg. Microbes
Infect. 2019;8(1):1370-82.
26.Sakuma S, Uchida Y, Kajita M, Tanikawa T,
Mine J, Tsunekuni R, et al. First Outbreak of an
H5N8 Highly Pathogenic Avian Influenza Virus on
a Chicken Farm in Japan in 2020. Viruses.
2021;13(3):489.
27.Saeed NM, Rashid PMA, Dyary HO. Ge-
netic characterization of highly pathogenic avian in-
fluenza A (H5N8) virus isolated from domestic
geese in Iraq, 2018. BMC Vet. Res. 2021;17(1):124.

  • تاریخ دریافت 12 آذر 1403
  • تاریخ بازنگری 08 بهمن 1403
  • تاریخ پذیرش 05 اسفند 1403