تعیین گروه‌های فیلوژنیک باکتری‌های اشریشیا کلی جدا شده از طیور گوشتی مبتلا به کلی‌باسیلوز در شهرستان زابل

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دستیار تخصصی، بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهرکرد

2 دستیار تخصصی، بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران

10.35066/J040.2018.983

چکیده

باکتری اشریشیا کلی یک ارگانیسم فرصت‌طلب است که ‌می‌تواند در طیور منجر به سندرم‌های کلی‌باسیلوز (کلی‌سپتی‌سمی، پریکاردیت، پری هپاتیت و سالپنژیت و...) گردد.  اشریشیا کلی دارای 4 گروه فیلوژنیکی شامل A، B1، B2  و D است.  فیلوتایپینگ ایزوله‌های اشریشیا کلی روشی مناسب جهت بررسی نوع پراکندگی گروه‌های فیلوژنیک ایزوله‌های اشریشیا کلی در مناطق مختلف ‌می‌باشد. بررسی حاضر به منظور تعیین گروه‌های فیلوژنیک  اشریشیا کلی در شهرستان زابل صورت گرفت، در این مطالعه به منظور تعیین فراوانی گروه‌های فیلوژنیکی باکتری اشریشیا کلی جدا شده از طیور گوشتی زابل، 144 قطعه جوجه گوشتی مشکوک به کلی باسیلوز نمونه‌گیری شد و در محیط  TSB به آزمایشگاه منتقل گردید. با انجام کشت‌های میکروبی و آزمایش‌های بیوشیمایی رایج  تعداد 100 ایزوله اشریشیا کلی تعیین هویت گردید، DNA باکتری‌های ایزوله شده به روش جوشاندن استخراج گردید و به روش triplex PCR گروه‌های فیلوژنیک آنها تعیین شد. در این مطالعه از مجموع 100 ایزوله، 36، 27، 23  و 14 درصد به ترتیب در گروه‌های  فیلوژنیک B1، D، A و B2  قرار گرفتند. با انجام مطالعه حاضر مشخص گردید که اغلب  ایزوله‌های اشریشیا کلی جدا شده از طیور گوشتی مبتلا به کلی‌باسیلوز در شهرستان زابل متعلق به گروه‌های  فیلوژنیک B1 بودند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Phylogenetic typing of Escherichia coli isolates collected from broilers with Collibacillosis in Zabol

نویسندگان [English]

  • Younes Teymouri 1
  • Reza Esmailzadeh Dizaji 2
چکیده [English]

Escherichia coli is an opportunistic organism which can cause Colibacillosis syndromes (colisepticemia, pericarditis, perihepathitis, salpingitis and …). E.coli has four phylogenetic groups including A, B1, B2 and D. Phylotyping is an adequate method for surveying the dissipation type of the phylogenetic groups of E.coli isolates in different regions. The present study was conducted to determine the phylogenetic groups of E.coli in Zabol city. In order to determine the frequency of the phylogenetic groups of E.coli in Zabol, 144 broilers suspected of Colibacillosis were sampled and samples were transferred to laboratory in TSB. After culturing and applying some common biochemistry tests, a total number of 100 E.coli were isolated. DNA of all isolates was extracted by boiling method and phylogenetic groups were determined by triplex PCR procedure. In this study; 36 %, 27 %, 23 % and 14 % of 100 E.coli isolates belonged to B1, D, A and B2 phylogenetic groups; respectively. The present study concluded that almost all of E.coli samples which were collected from broilers suspected of Colibacillosis in Zabol belonged to B1 phylogenetic group.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Broiler
  • Colibacillosis
  • Escherichia coli
  • Phylogenetic
  • Zabol
  1. Nolan LK, Barnes HJ, Vaillancourt JP, Abdul-Aziz T, Logue CM. Dis poult. 2013:751-805.
  2. Dho M, Lafont J. Escherichia coli colonization of the trachea in poultry: comparison of virulent and avirulent strains in gnotoxenic chickens. Avian Dis. 1982:787-97.
  3. Gross W. Diseases due to Escherichia coli in poultry. FAO. 1994.
  4. Spaeth R. Morphological character mapping on a molecular phylogeny using pollen variation in the Cryptanthinae (Boraginaceae): Department of Biology, Sonoma State University; 2014.
  5. Ochman H, Selander RK. Standard reference strains of Escherichia coli from natural populations. Jl of bacteriol. 1984; 157(2): 690-3.
  6. Lecointre G, Rachdi L, Darlu P, Denamur E. Escherichia coli molecular phylogeny using the incongruence length difference test. Mole biol and evol. 1998; 15(12):1685-95.
  7. Walk ST, Alm EW, Calhoun LM, Mladonicky JM, Whittam TS. Genetic diversity and population structure زof Escherichia coli isolated from freshwater beaches. Environ microbiol. 2007; 9(9):2274-88.
  8. Bergthorsson U, Ochman H. Distribution of chromosome length variation in natural isolates of Escherichia coli. Mole Biol Evol. 1998; 15(1):6-16.
  9. Gordon DM, Clermont O., Tolley H., Denamur E. Assigning Escherichia coli strains to phylogenetic groups: multi‐locus sequence typing versus the PCR triplex method. Environ microbiol. 2008; 10(10):2484-96.
  10. Asadi S, Solhjoo K, Kargar M, Rezaeian A. Phylogenetic groups of Escherichia coli strains isolated from urinary tract infection in Jahrom city, southern Iran. J Microbiol World. 2011; 3:245-50. [In Persian].
  11. Miyazaki J, BaThein W, Kumao T, Obata Yasuoka M, Akaza H, Hayshi H. Type 1, P and S fimbriae, and afimbrial adhesin I are not essential for uropathogenic Escherichia coli to adhere to and invade bladder epithelial cells. Pathog Dise. 2002; 33(1):23-6.
  12. Zahraei-Salehi T, Shayegh J. Veterinary Microbiology and Microbial Disaese. Tehran, University of Tehran Press, 1386:164-176. [In Persian]
  13. Sambrook JR, Russell 2001 Molecular cloning: a laboratory manual. Q Rev Biol. 2001; 76(3):348-9.
  14. Mills M, Payne SM. Genetics and regulation of heme iron transport in Shigella dysenteriae and detection of an analogous system in Escherichia coli O157: J Bacteriol. 1995; 177(11):3004-9.
  15. Clermont O, Bonacorsi S, Bingen E. Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Applied and environmental microbiology. 2000; 66(10):4555-8.
  16. Gross W, Domermuth C. Dise poult. 1991; 9:780-97.
  17. Kariyawasam S, Scaccianoce JA, Nolan LK. Common and specific genomic sequences of avian and human extraintestinal pathogenic Escherichia coli as determined by genomic subtractive hybridization. BMC microbiol. 2007; 7(1):81.
  18. Bashir S, Sarwar Y, Ali A, Mohsin M, Saeed MA, Tariq A, and et al. Multiple drug resistance patterns in various phylogenetic groups of uropathogenic Escherichia coli isolated from Faisalabad region of Pakistan. Braz J Microbiol. 2011; 42(4):1278-83.
  19. Wu H, Xia S, Bu F, Qi J, Liu Y, Xu H. Identification of integrons and phylogenetic groups of drug-resistant Escherichia coli from broiler carcasses in China. Int J Food Microbiol. 2015; 211:51-6.
  20. Hiki M, Usui M, Akiyama T, Kawanishi M, Tsuyuki M, Imamura S, et al. Phylogenetic grouping, epidemiological typing, analysis of virulence genes, and antimicrobial susceptibility of Escherichia coli isolated from healthy broilers in Japan. Ir Vet J. 2014; 67(1):14.
  21. Jakobsen L, Kurbasic A, Skjøt-Rasmussen L, Ejrnæs K, Porsbo LJ, Pedersen K, et al. Escherichia coli isolates from broiler chicken meat, broiler chickens, pork, and pigs share phylogroups and antimicrobial resistance with community-dwelling humans and patients with urinary tract infection. Foodborne Pathog Dis. 2010; 7(5):537-47.
  22. Hassani B, Shayegh J, Ameghi A, Mikaili P, Mahmmudzadeh M. Phylogenic typing of Escherichia coli isolated from broilers with collibacillosis in Tabriz, North West of Iran. Arch Razi Inst. 2013; 68(1):43-6.
  23. Kotlowski R, Bernstein CN, Sepehri S, Krause DO. High prevalence of Escherichia coli belonging to the B2+ D phylogenetic group in inflammatory bowel disease. Gut. 2007; 56(5):669-675.
  24. Johnson TJ, Wannemuehler Y, Johnson SJ, Stell AL, Doetkott C, Johnson JR, et al. Comparison of extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains from human and avian sources reveals a mixed subset representing potential zoonotic pathogens. Appl Environ Microbiol. 2008; 74(22):7043-50.
  25. Abdi HA, Rashki A, Rashki Z, Shahkarami F, Shahraki Z. The Relationship Between Phylogenetic Group and Distribution Of Virulence Genes HlyA, IroN, IucD, FimH In Escherichia Coli Isolated From Female Genital Tract Among Women Attending Gynecology Clinics In Zabol-Iran By Multiplex-PCR. Iran J Med Microbiol. 2014; 7(4):9-15. [In Persian].